Что такое корень древа?
Сервис планировался для создания генеалогического (семейного) древа кровных родственников. Корень древа - это персона, которая заполняет древо (или для которой древо заполняется). Это Я. Есть Я, а у МЕНЯ есть братья и сёстры. Есть МОИ родители, у них есть братья и сёстры. Есть МОИ дедушки и бабушки, а у них есть братья и сёстры. Та персона, чья ветвь семейного древа основная.
Эти самые персоны "я" и "мои" - первостепенные. В оригинальном виде древа, где персоны представлены кружочками, это самые крупные кружочки, а вокруг них собираются кружочки помельче, потому что они... ну, второстепенны. В другом виде древа - в виде небольших профилей - первостепенные персоны являются основными узлами, а братья и сёстры размещаются ниже и очерчиваются более светлой рамкой.
Когда вы импортируете древо, нужно указать, кто из возможных корней будет располагаться в самом начале, от кого будет расти ваше древо. Если у такой персоны нет братьев и сестёр, она будет выбрана автоматически. Это нужно для создания семейного древа одного человека. Информация об этом при экспорте древа будет утеряна, да и бесполезна она для других сервисов. Если импортировать деревья родословной королевских особ royal92, семейного древа персонажей из книг о Гарри Поттере, из мультфильма Симпсоны или семейства операционных систем Windows, то там выбор корня не имеет никакого значения.
Неприятности случаются, когда корень дерева определить невозможно; непонятно, от кого это древо будет расти. Например, если вы женаты или замужем, вы собрались в семью в файле gedcom и начали вести семоейное древо, то, во-первых, нельзя будет определить, чьё это древо, а во-вторых, это лишено смысла, ведь у вас с вашим супругом (или супругой) нет кровного родства (надеемся). С точки зрения закона вы родственники, с точки зрения генеалогии - посторонние люди. У ваших детей, когда они будут (надеемся), будет кровное родство с вами обоими (надеемся), а у вас нет. По сути, тут будет два отдельных древа, никак между собой не связанные.

Если такое произойдёт, то корнем дерева будет выбрана первая персона, найденная в файле gedcom. Ничего страшного не случится, просто "переместить к корню" будет вести фиг знает куда, куда-нибудь в середину древа.
В формате gedcom, который повсеместно используется для хранения информации о родословной, такого понятия нет, там есть понятие "семья". Но человек, который сделал этот проект, ничего не знал о генеалогии, и ему идея собрать второстепенных персон возле первостепенных показалась очень красивой.